Problema:
Al instalar como servicio el Tomcat y tratar de arrancar el mismo este no arranca y me envía el mensaje “[174 javajni.c] [error] %1 is not a valid Win32 application.” en el visor de eventos, en un windows server 2003 de 64 bits.
Solución:
La solución es reemplazar los archivos tomcat6.exe y tomcat6w.exe que se encuentran en la carpeta bin del Tomcat con versiones de 64 bits. Para eso ve a aqui y da click en Browse native binaries download area, selecciona carpeta windows y descarga el archivo commons-deamon-1.0.5-bin-windows.zip. Extrae los archivos prunmgr.exe y amd64/prunsrv.exe y reemplaza con estos el tomcat6w.exe y tomcat6.exe respectivamente. Si inicias el servicio de Tomcat este deberá iniciar sin problemas.
Suerte!